Cơ cấu trung tâm:
– Ban lãnh đạo: Giám đốc; Phó Giám đốc
– Các phòng chuyên môn: Phòng Hành chính – Tổng hợp; Phòng Khoa học Công nghệ và Môi trường; Phòng Đào tạo và Hợp tác quốc tế.
Hiện nay, cán bộ trung tâm thuộc nhiều lĩnh vực và chuyên ngành khác nhau như Nông nghiệp; Công nghệ Hóa, Hòa phân tích; Công nghệ sinh học; Điện-điện tử; Cơ khí chế tạo; Quản lý, khoa học, kỹ thuật, công nghệ môi trường …